Pohjanmaan museo on Vaasan kaupungin ylläpitämä kaupunki-, maakunta- ja aluetaidemuseo sekä luonnontieteellinen museo. Museo hoitaa tehtävänsä museolain mukaisesti, Opetus- ja kulttuuriministeriön alaisuudessa. Pohjanmaan museo on osa Suomen valtakunnallista museotoimintaa, jota organisoi ja ohjeistaa Museovirasto.

Pohjanmaan museon toiminta-alueita ovat kulttuurihistoria, taide ja luonnontiede. Jokaisella alueella on oma osasto. Koko museota johtaa museotoimenjohtaja ja jokaista osastoa johtaa intendentti. Museossa toimii lisäksi eri alojen amanuensseja, tutkijoita ja konservaattoreita.